Por lo general, la expectativa de vida para personas con enfermedad mixta del tejido conectivo es favorable, pero esto depende principalmente de los signos y síntomas presentes en cada paciente.
La tasa de supervivencia a 10 años desde el diagnóstico de la enfermedad es de alrededor del 80% , de hecho, algunas personas tienen periodos de remisión que duran muchos años.
Sin embargo, un 13% de los afectados ve como la enfermedad mixta del tejido conectivo empeora y puede causar complicaciones potencialmente fatales en un periodo de entre seis y 12 años.
Aquellos pacientes con características de esclerosis sistémica o polimiositis tienen una esperanza de vida más comprometida. La causa más común de muerte asociada a la enfermedad mixta del tejido conectivo es la hipertensión muscular.