L'EM sfc n'est pas une maladie psychiatrique. Les thérapies de type psychologique ou psychiatrique et/ou les antidépresseurs ou autres psychotropes ne sont pas des traitements de l'EM. Mais comme dans toute maladie chronique invalidante, il y a beaucoup d'obstacles à surmonter, de deuils à faire et certains malades peuvent être fragilisés, voire développer une dépression réactionnelle, qui doit être traitée.
Certains antipsychotiques dits "atypiques" ou certains antidépresseurs tels que l'amitryptilline peuvent être utilisés à très faible dose avec succès chez certains malades, notamment pour diminuer les douleurs neurogènes. Il est important que ces molécules soient prescrites par un neurologue ou un neuropsychiatre qui s'informe auparavant sur l'EM sfc.