Les traitements recommandés pour la maladie de Crohn et la Colite Ulcéreuse varier en fonction de la participation de chaque patient. Bien que de nouveaux médicaments sont émergents, le protocole à suivre est très prévues. Le patient a tendance à avoir un traitement d'entretien, sauf dans les cas où il n'est pas nécessaire, qui consistent généralement en la prise d'immunosuppresseurs et/ou des traitements biologiques. Ce traitement vise à maintenir le patient en rémission et de contrôle des symptômes. Les périodes d'épidémies est généralement contrôlée par de fortes doses de corticostéroïdes. Dans les cas les plus graves, il est nécessaire de recourir à la chirurgie.
Les traitements actuels sont donne de très bon résultats, et bien que chaque personne réagit différemment à eux, la majorité des personnes touchées gérer pour améliorer grandement votre qualité de vie.