Les causes de la dysautonomie varient selon le type de dysfonctionnement du système autonome. Certaines des causes sont:
-Atoimmune de la Maladie (par exemple, à l'APS, l'Amylose, la Sarcoïdose, la maladie de Charcot-Marie-Tooth, Maladie de Sjögren)
-Troubles neurologiques (par exemple, la malformation de chiari, une raideur de la personne, le syndrome de Myasthénie grave)
-Troubles endocriniens (par exemple, le Diabète
- Syndromes vasculaires (par exemple, casse-noisette, le Syndrome de l'Artère Mésentérique Supérieure, le Syndrome de May-Thurner, le Syndrome de Congestion Pelvienne, le Syndrome de MALS)
-Des Cellules de mât Troubles (par exemple, MCAD, le traitement de la Mastocytose)
-Syndrome D'Ehlers-Danlos
-Les Maladies Mitochondriales
-Des Carences En Vitamines