Zalecane sposoby leczenia choroby leśniowskiego-Crohna i Wrzodziejące zapalenie jelita Grubego różnią się w zależności od zaangażowania każdego pacjenta. Chociaż nowe leki pojawiają się protokół nadal bardzo przewidziane. Pacjent jest zazwyczaj mieć leczenie podtrzymujące, z wyjątkiem przypadków, gdy nie ma takiej potrzeby, że, jak zwykle, z przyjmujących leki immunosupresyjne i/lub biologicznej. Leczenie to ma na celu wspierać pacjentów w stanie remisji i kontrolować objawy. Okresy lamp błyskowych, jak zwykle, sterowane przy dużych dawek kortykosteroidów. W przypadku wyższych częstotliwości, należy uciekać się do operacji.
Istniejących metod leczenia daje bardzo dobre wyniki, i mimo, że każdy człowiek reaguje inaczej na nich, większość poszkodowanych otrzymują znacznie poprawić jakość swojego życia.