A condição é congênita, mas alguns formulários podem ser adquiridos mais tarde na vida, principalmente em mulheres.
A exata causa genética é desconhecido, com mais de 25 diferentes gene / alelos de ter sido encontrado para causar casos de síndrome de Kallmann.
A causa é a falha do hipotálamo, glândula para a liberação de GnRH para que a hipófise a liberar os hormônios LH e FSH corretamente. É a ausência de LH e FSH, que causa a infertilidade e a falta de puberdade.
O hipotálamo pode falha para a liberação de GnRH, quer porque lhe falta o correto células nervosas para fazê-lo ou o mecanismo de tempo não funciona corretamente, o que significa que o GnRH não é liberada de forma correcta para a glândula pituitária para ser capaz de responder.