Normalmente são hereditárias
São causadas por erros genéticos das células que formam o sistema imunológico
Alguns como no caso das igA a deficiência seletiva de IgA pode ocorrer como conseqüência de infecção intra-uterina congênita da rubéola (sarampo alemão ou três dias), toxoplasmose (doença causada pela infecção pelo protozoário) ou cytomegalavirus (um tipo comum de vírus do herpes) ou por alguns fármacos que apos retirados a deficiência se controla