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La esperanza de vida con Síndrome de Alagille es todavía incierta. Sin embargo, si la enfermedad se trata lo suficientemente temprano, los pacientes (especialmente los niños) pueden disfrutar de vidas largas y productivas.
Las personas con problemas cardíacos avanzados que requieren cirugía pueden tener una esperanza de vida más corta. Lo mismo se espera en aquellos pacientes con anormalidades severas de los vasos sanguíneos, ya que pueden provocar hemorragias dentro del cerebro.
Los investigadores trabajan arduamente para encontrar una cura para el Síndrome de Alagille. Mientras tanto, todos los tratamientos están avocados a prevenir y aliviar los signos y síntomas relacionados con la enfermedad.