Si se trata de forma adecuada con colchicina durante toda la vida, los niños con FMF tienen una vida normal. Si existe un retraso en el diagnóstico o una falta de cumplimiento con el tratamiento, el riesgo de desarrollar amiloidosis aumenta, asociando un mal pronóstico. Los niños que desarrollan amiloidosis pueden requerir un trasplante renal.
El retraso en el crecimiento no es un problema freceuente en la FMF.